L’institut Pasteur de Côte d’Ivoire (IPCI) est le laboratoire national de référence pour les méningites et il est le partenaire direct de l’Institut National d’Hygiène Publique, organisme responsable de la surveillance épidémiologique. L’IPCI utilise la méthode PCR en routine pour la surveillance des méningites bactériennes en Côte d’Ivoire. La PCR est adaptée à l’éloignement du laboratoire référence par rapport à la partie nord du pays, où les épidémies de méningite sont à craindre. Le transfert des échantillons biologiques peut présenter des difficultés logistiques, mais la PCR permet de s’affranchir de la fragilité des germes qui est un frein au diagnostic par culture.
En 2008, le laboratoire a connu quelques difficultés avec la technique PCR appliquée aux méningites et un arrêt temporaire de l’emploi de cette technique dans la surveillance des méningites s’est imposé. Des soucis liés à un manque de reproductibilité ont été rapportés à un réactif utilisé pour la préparation des mix. Par ailleurs, pour tenter de diminuer la proportion de résultats négatifs, qui pouvaient être liés à une contamination des échantillons, les cliniciens ont été priés de collecter systématiquement les LCR dans deux tubes, dont l’un destiné uniquement à la PCR. Enfin, quelques résultats discordants entre culture et PCR ont été attribués à la présence possible d’inhibiteurs. Tous ces problèmes ont été heureusement résolus par l’intervention du coordinateur pour les questions de biologie.
Chaque semaine, le laboratoire transmet ses résultats à l’INHP qui les communique au Ministère de la Santé et à l’Organisation Mondiale de la Santé.
Activités de surveillance microbiologique des méningites au laboratoire de l’IPCI
|
|
2007
|
2008
(au 30/09)
|
|
Nb d’échantillons de LCR examinés
|
533
|
526
|
|
Nb de LCR mis en culture
|
533
|
526
|
|
Nb de cultures positives
|
26
|
32
|
|
Nb de tests latex réalisés
|
300
|
174
|
|
Nb de tests latex positifs
|
28
|
48
|
|
Nb de LCR testés par PCR
|
291
|
155
|
|
Nb de LCR positifs en PCR
|
42
|
20
|
|
Nb de tests de sensibilité aux antibiotiques
|
26
|
32
|
Résultats de la surveillance microbiologique des méningites à l’IPCI
|
|
2007
|
2008 (au 30/09)
|
|
|
Culture
|
Latex
|
PCR
|
Culture
|
Latex
|
PCR
|
|
S. pneumoniae
|
10
|
9
|
14
|
9
|
11
|
5
|
|
H. influenzae b
|
5
|
4
|
5
|
6
|
9
|
4
|
|
N. meningitidis (Nm) A
|
5
|
9
|
18
|
16
|
25
|
9
|
|
Nm C
|
3
|
3
|
3
|
0
|
1
|
0
|
|
Nm W135/Y
|
2
|
2
|
0
|
1
|
2
|
0
|
|
Nm indéterminé
|
0
|
0
|
2
|
0
|
0
|
0
|
|
S. agalactiae (group B)
|
1
|
1
|
0
|
0
|
0
|
0
|
